1、运营商不同：菜鸟驿站是由菜鸟网络牵头，建立面向社区和校园的物流服务平台，而妈妈驿站是圆通速递旗下的一个项目。2、效率不同：菜鸟驿站的自动化更高，所有快递可以一扫入库，一键发收货码，效率更高。而妈妈驿站则需要多步操作，不同地区差异很大，收件和取件速度都慢一些。
妈妈驿站和菜鸟驿站的区别
妈妈驿站——圆通的妈妈驿站，是自提货、代发快件的地方当快递公司把快件放到妈妈驿站时，驿站的工作人员扫描入库，这时若是淘宝快件就会触发短信给收货方，若不是淘宝快件就需手动输入手机号码发短信给收货方。
菜鸟驿站——是一个由菜鸟网络牵头建立面向社区和校园的物流服务平台网络平台，作为菜鸟网络五大战略方向之一，为网购用户提供包裹代收服务，致力于为消费者提供多元化的最后一公里服务。目前，在末端配送网络建设上，在城市超过4万个菜鸟驿站构成菜鸟网络的城市末端网络。
菜鸟网络于2013年5月28日成立，股东除了阿里巴巴、银泰、复星，还包括富春投资、顺丰和三通一达。2015年5月28日，阿里巴巴举行首届菜鸟江湖大会，菜鸟网络总裁童文红首次对外解读菜鸟战略，称菜鸟定位于“社会化物流协同、以数据为驱动力的平台”，并且明确五大战略：快递、仓配、跨境、农村和驿站。
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